E-dNa analys. På jakt efter signalkräftor
Med Jämna Mellanrum får vi i Eda kommun besök av Länsstyrelsen i Värmland.
Det kan t ex vara för att inventera Musslor, göra provfisken efter fisk eller kräftor men även E-dNa prover.
Environmental dNa
E-dNa står för environmental dNa ( miljö dNa). Alltså dNa som vi kan hitta i vår natur. Det kan vara allt möjligt men eftersom vi letar i limnisk miljö ( sötvattens miljö ) så är det i första hand dNa som efterlämnats av djur som lever i just sötvatten. Det kan vara olika saker man är ute efter när man letar detta dNa, det kan vara djur som inte hör hemma på platsen, så kallade invasiva arter eller tex parasiter eller en specifik art. I vårat område har speciellt letat efter flodkräftor, signalkräftor samt kräftpest.
Procedur
Det är en väldigt avanverad procedur för att få fram dessa dNa så detta görs oftast i laboratorie.Fältarbete för att samla in dNa är däremot betydligt lättare.
Vi börjar med att placera ett speciellt filter i en filterhållare som man pumpar 5 liter vatten genom. Alltså vatten från det vattendrag där man vill leta efter någonting.
Pumpen vi använder visar digitalt hur mycket vatten som pumpats igenom filtret.
När vi pumpat vattnet genom filtret så ska filtret placeras med försiktighet i ett provrör som sedan skickas på analys på SVA (statens veterinärsmedicinska anstalt)
I filtret finns nu jättemycket olika dNa från arter i vattnet. Det dem gör på labbet nu är att leta efter just det dNa som de arter har som vi letar efter. Hittar man inget så blir det ett negativt resultat och hittar man så blir det positivt och man kan även få fram hur stor koncentration det var av just det dNat. Detta säger inte mycket mer än att det är ganska säkert att det inte är en felträff. På samma sätt letar vi efter kräftpestsporer i vattnet och får träff i filtren på labb.
Det har visat sig att det är svårare att leta dNa som hör ihop med kräftor än fisk , detta troligtvis för att kräftorna helt enkelt ger ifrån sig mindre dNa än fisk. Vi har iaf tack vare denna metod kunna hitta områden där kräftpest håller på för fullt. Vilket vi varit tvungna med innan att göra genom att skicka in döda kräftor.
Metoden är fortfarande under utveckling , men redan på några år har man lyckats att utveckla så att man kunnat utföra labbarbetet i fält med svar på under en timma.
Bilden ovan visar ett labbresultat i fält. Resultatet påvisar fynd av Flodkräfta och Kräftpest men ingen signalkräfta.
Vill du se en film från hur ett labbreslutat i fält går till klicka nedan
